N1H Cloud y LeishGen: Las plataformas de análisis de Nano1Health en London Calling 24
El 22 y 23 de mayo, nuestro equipo, con ocho años de experiencia dedicada a la secuenciación por nanoporos, asistió a London Calling 24, la reunión de usuarios de Oxford Nanopore Technologies que celebra una década desde su comercialización. Esta conferencia nos permitió aprender sobre los últimos avances técnicos y aplicaciones de la secuenciación por nanoporos y compartir nuestras innovaciones con investigadores, clínicos y líderes de la industria.
Durante la conferencia, nuestra candidata a doctorado industrial, Marina Carrasco, presentó nuestros últimos resultados sobre la predicción de resistencia a fármacos en Leishmania y el desarrollo de test diagnósticos en su póster ""Drug-resistance Biomarkers in Leishmania infantum through Nanopore Sequencing and Structural Variants Analysis". Este trabajo, que recibió la distinción de "Mención de Honor" en la conferencia, es un paso significativo en nuestros esfuerzos colectivos para entender y combatir la leishmaniasis.
En su presentación, mostramos nuestras plataformas de predicción de resistencia a fármacos, LeishGenApp y LeishGenR, desarrolladas durante dos años con el apoyo del CDTI como parte del proyecto Neotec, una iniciativa de investigación destinada a desarrollar soluciones innovadoras para combatir la leishmaniasis. Estas plataformas están diseñadas para detectar resistencia a los tratamientos estándar contra Leishmania infantum. LeishGenApp utiliza la secuenciación del genoma, la bioinformática avanzada y la visualización de datos para identificar biomarcadores genéticos de resistencia a partir de muestras cultivadas. LeishGenR es una herramienta IVD robusta para analizar directamente muestras clínicas.
Este desarrollo fue posible gracias a la colaboración con varios socios internacionales. Establecimos una cohorte de 46 aislados de Leishmania infantum que infectaban a perros o humanos y secuenciamos su genoma completo con tecnología de nanoporos, logrando una integridad promedio del genoma del 98,4%. A través de LeishGenApp, identificamos biomarcadores de resistencia para los cinco fármacos más comunes contra Leishmania infantum, detectando marcadores de resistencia a fármacos en el 89% de los aislados.
Además, nuestro investigador postdoctoral Torres Quevedo, Joan Martí-Carreras, presentó uno de los activos clave de nuestra compañía, N1H Cloud (https://www.nano1health.com/n1h-cloud/), nuestra plataforma web de análisis para secuenciación por nanoporos. Esta plataforma, diseñada para una aproximación One Health, integra LeishGenApp, así como varios productos de análisis para secuenciación y ensamblaje de genomas completos (N1H-Assemblatron), 16S (N1H-Amplitron) y próximamente nuestro clasificador de metagenómica (N1H-Metagenomics).
Para más información sobre nuestra investigación y cómo podemos abordar estos desafíos, no dude en contactar con nosotros en info@nano1health.com o en nuestro sitio web www.nano1health.com.